Το Πλαίσιο Λειτουργίας του Γεωπονικού Πανεπιστημίου Αθηνών καθορίζει τη δομή, τις διαδικασίες και τις αρχές που διέπουν την οργάνωση και τη λειτουργία του Ιδρύματος. Αποτελεί τον θεσμικό οδηγό για την εφαρμογή του Εσωτερικού Συστήματος Διασφάλισης Ποιότητας, τη διαμόρφωση στρατηγικής ανάπτυξης και τη διασφάλιση της εύρυθμης λειτουργίας όλων των ακαδημαϊκών και διοικητικών μονάδων, με στόχο την παροχή υψηλού επιπέδου εκπαίδευσης, έρευνας και υπηρεσιών προς την κοινωνία.